Se dice que es la tercera temporada de las anteriores series Digimon. Si nos basamos en esta idea, seria la tercera temporada, aunque han aparecidopersonajes de temporadas pasadas, pero en algunos casos aparecen digimons de temporadas anteriores.
Este anime cuenta la historia de Takato y su viaje al Digimundo con su digimon llamado Guilmon, y sus amigos tamers: Hirokasu, Kenta, Henry, Ryo y Rika.Todo comienza un día normal enla vida. Como siempre al inicio del día va al parque para encontrarse con sus amigos y jugar con sus cartas antes de la escuela. Cuando llega la hora de entrar a clases, sus amigos (kenta y hirokasu) corren para evitar llegar tarde, Takato se queda acomodando y guardando sus cartas, pero cuando guarda su lector de cartas se da cuentaque estaba fallando, o eso creía, pero no le da importancia así que lo dejaensu caja como de costumbre.
Durante el periodo de clases era tanto el gusto que tenia por los digimon que siempre diseñaba digimons.
Takato tenia una compañera llamada Yuri (la cual le gustaba a Takato). Ella siempre seguia a Takato y le preguntaba porlo que hacia durante clase. Yuri, siemrpe llevaba un titere consigo con quien, algunas veces, hablaba, como si el titere tuviera vida propia. Muchos decían que era rara porque tenia una vida muy complicada, ya que su mamá había muerto hace algunos años, supadre se volvio a casr con otra mujer, la mujer no era el problema porque ella era muy amable con Yuri y ela le respondia de igual manera, pero su padre era muy estricto con ella y hasta algunas veces grosero.
Al regresar de la escuela, Takato tomo un desvio de regreso a casa por el parque para ver sus cartas y se da cuenta que su lector de cartas se habia convertido en un digibice. Desconcertado se lo lleva a su casa paraanalizarlo. Cuando Takato empieza a observarlo se da cuenta que en los costados habia o tenia un lector de tarjetas pero no sabia de que tipo, así que sele ocurre pasar uno de sus dibujos de diseños de digimons, el dibujo se traba en el digibice y lo jala para el interior del aparato. Eneso su mamá lo llama para que se metiera a bañar. Rápidamente se va al baño a ducharse como selo habia indicado su mamá. Dejo el digibice sobre el buro, y mientras el se ducha, el digibice se enciende y aparece la imagen de un digihuevo en crecimiento.
Después de terminar de ducharse se percata de esta imagen pero no entiende lo que esto quiere decir, así que piensa que no es nada relevante y lo deja sobre su buro toda a noche.
A la mañana siguiente el digibice seguia intacto, tal cual como lo había dejado, y al parecer el digihuevo seguía creciendo, pero Takato ya tenía que prepararse para ir ala escuela así que dejo el digibice en su buro y se prepara para irse.
Durante clases Takato estuvo pensando enlo sucedido. Pero llego el final del día, regreso asu casa ansioso y corriendo, cuando ve el digibice y se da cuenta que estaba parpadeando como si el digihuevo estuviera a punto de nacer. Cuando Takato vio eso el el digibice aparecio un mapa que conducia hacia donde iba a nacer el digihuevo. Alarmado corre en busca del digihuevo.
Después de una extensa carrera Takato llego al lugar en donde nace el digihuevo. Cuando el digihuevo se rompe, el digimon lanza una bola defuego de su boca.
El digimon era un lagarto (dinosaurio) de color naranja con algunas rayas en el lomo y en la cola de color negro, su tamaño era casi el mismo que el de Takato, a quién lo nombro Guilmon.
Takato lo recoge y lo lleva a su casa cuidando que sus padres nolo vean (esto fue un poco dificil ya que era un lagarto).
A partir de ese nacimiento del digimon, Takato tendra que aprender a utilizar su dicibice para poder utilizar a Guilmon para combatir contra otros digimons.
También conocera a otros tamers como Henry quien lo ayudara a entender las cosas del digimundo junto a su digimon Terriermon, y a Rika que le enseñara la parte dura de los digimons junto a su digimon Reenamon.
A lo largo de la serie viajaran al digimundo y tendran que tomar una dificil decision al final de la serie todos los tamers existentes.